মিসরের কায়রোতে অবস্থিত বিশ্ব বিখ্যাত আল-আজহার বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রধান মসজিদটিই আল-আজহার মসজিদ হিসেবে পরিচিত। ৯৭২ সালে জাওহার আল-সিকিলির নতুন প্রতিষ্ঠিত রাজধানী কায়রোর জন্য এটি নির্মাণ করা হয় এবং রমজানের ৭ তারিখ এটির আনুষ্ঠানিক যাত্রা শুরু হয়। 

আজ-জাহরা হজরত ফাতিমা (রা.)-এর উপাধী। আজ-জাহরা থেকেই আল-আজহার শব্দের উৎপত্তি। ফাতেমি আমলে নির্মিত হওয়ায় হজরত ফাতিমার পবিত্র স্মৃতির উদ্দেশ্যে এর নাম রাখা হয় আল-আজহার। 

প্রতিষ্ঠার পর ৯৮৯ সালে মসজিদ কর্তৃপক্ষ ৩৫ জন ইসলামি পণ্ডিতকে শিক্ষক হিসেবে নিয়োগ দেয়। এরপর ধীরে-ধীরে মসজিদটি বিকশিত হতে থাকে। পর্যায়ক্রমে তা অন্যতম সেরা বিশ্ববিদ্যালয়ে পরিণত হয়। পুরো বিশ্বে যা আল-আজহার বিশ্ববিদ্যালয় নামে পরিচিত। আল-আজহার দীর্ঘদিন ধরে সুন্নি ধর্মতত্ত্ব ও ইসলামি আইন অধ্যয়নের জন্য মুসলিম বিশ্বের সেরা প্রতিষ্ঠান বিবেচিত হয়ে আসছে। 

প্রতিষ্ঠার পর আইয়ুবি শাসনামলে এই বিদ্যালয় অবহেলার শিকার হয়। কারণ শিয়া ইসমাইলিদের হাতে প্রতিষ্ঠিত হওয়ায় আইয়ুবি রাজবংশ আল-আজহারকে পৃষ্ঠপোষকতা দেয়নি। অবশ্য মামলুক শাসনামল থেকে আজ পর্যন্ত ভালোই উন্নতি করেছে আল-আজহার বিশ্ববিদ্যালয়। এ বিশ্ববিদ্যালয়কে বর্তমানে মুসলিম বিশ্বের সবচেয়ে প্রভাবশালী প্রতিষ্ঠান এবং মিসরের ইসলামের প্রতীক মনে করা হয়।